有几种特征不能通过运行测试程序而自动猜测出来。例如，目标文件格式的细节，或者需要传递给编译器或连接器的特殊选项。 你可以使用同类手段（ad-hoc means）来检查这类特征，比如说让configure检查uname程序的 输出，或者寻找仅仅在特定系统中出现的库。然而，Autoconf为处理不可猜测的特征提供了统一的手段。